懷孕時女性的免疫力會變差，使得外界的病菌更容易入侵。此外，懷孕初期如果感染了某些病毒，也可能導致胎兒生長發育受到影響。
德國麻疹病毒(Rubella virus)是一個胎兒最不想遇到的敵手。正常成人感染到德國麻疹病毒，常見症狀為發燒、頭痛、酸痛，淋巴結腫大及全身性不規則的斑丘疹，大約一週左右會自然痊癒。
然而如果孕婦於懷孕早期(未滿3個月內)感染到了德國麻疹病毒，胎兒有約90%的機會被感染，有25%的機會會產生先天性德國麻疹症候群(congenital rubella syndrome)。先天性德國麻疹症候群可能會使胎兒產生一種到多種的生長缺陷(例如心臟、聽力、智力、骨骼、或肝脾等異常)。也因此政府補助育齡婦女(15歲~49歲)如檢具近3個月內之德國麻疹抗體檢驗陰性報告者，可至合約院所施打1劑公費的麻疹德國麻疹腮腺炎疫苗(MMR)。
一般人感染水痘的主要症狀是發燒、頭痛、酸痛、疲倦和身體出現紅色丘疹和水泡，症狀大約維持一週左右就會自然痊癒。感染過水痘後幾乎都可以終身免疫，不會再得到一次水痘，然而痊癒後並不代表水痘病毒離開了我們身體，這些水痘病毒會躲在人體的神經節裡潛伏著，等到我們年紀較大時，或抵抗力較弱時又再趁機跑出來作怪(復發的水痘病毒感染叫做帶狀疱疹，即俗稱的皮蛇)。
然而，如果是孕婦在懷孕20週以前感染到水痘，胎兒可能會因此被感染，進而有機會(0.4%~2%)產生先天性水痘症候群(congenital varicella syndrome)，導致胎兒神經、四肢，皮膚和眼睛等生長發育受到影響。
台灣在民國93年開始正式於滿1歲的寶寶公費施打水痘疫苗，也就是民國92年1月1日之後出生的寶寶大多都有接種過水痘疫苗。也因此民國92年之後出生的人，許多人是沒有自然感染過水痘的，同時水痘疫苗的抗體保護力大多在5~10年內就會消失。因此我們建議如果不確定小時候是否有感染過水痘的育齡女性，可以考慮檢測血液水痘的抗體保護力，評估是否需要自費追加疫苗。
另外要特別提醒的是，水痘疫苗和MMR疫苗都是活性疫苗，懷孕時是禁止施打的。此外，這些疫苗施打完都建議至少避孕一個月，避免疫苗內活性減毒的病毒影響到胎兒。也因此我們建議育齡婦女如有準備懷孕規劃，可以提早3個月以上的時間準備這些疫苗的施打。
流感疫苗和新冠病毒疫苗其實懷孕女性也可以安全施打，但因為孕婦本身就是流感和新冠病毒感染的中重症高風險族群，我們建議如果在流感疫苗或是新冠疫苗施打的時期，可以盡早在未懷孕前就先行接種。
B型肝炎疫苗更是台灣疫苗史上重大的成就之一。B型肝炎疫苗於民國73年開始逐步施打於高風險的新生兒，於民國75年開始新生兒全面施打。在此之前，台灣民眾有B型肝炎帶原的比例高達15%至20%。
B型肝炎帶原的人未來會有較高的機會得到肝硬化、肝癌。這也是為什麼肝癌一直是國人重大的死因之一。隨著疫苗施打的普及，B型肝炎帶原的比例也因此不斷下降(目前約5~10%)。
B型肝炎病毒傳染的途徑主要是透過血液和體液傳染，或是母子垂直傳染(生產前後B肝帶原的媽媽傳染給胎兒)。翻開新生兒預防接種手冊，其實寶寶出生後的第一支預防針就是B型肝炎疫苗。針對育齡的女性，我們也建議可考慮檢驗B型肝炎抗體的保護力是否足夠，如不足時也可以考慮追加一劑B型肝炎疫苗。
流感疫苗、新冠疫苗和B型肝炎疫苗為非活性疫苗，打完後不需要特別避孕。